Calibre y la microSD del lector Kobo

Hasta ahora pasaba los libros al lector Kobo Aura HD mediante el sencillo método "copiar&pegar" en su raiz. La primera vez que utilicé Calibre para pasarlos, observé que tras su expulsión y desconexión del cable usb, se resetea el dispositivo y recomienda formatear la microSD porque no la reconoce. Los libros se han instalado en la raiz, como he dicho. Cada vez que reseteo el lector aparece idéntico mensaje. Conecto el lector al pc y compruebo que en su memoria externa, además de la carpeta de KoboStorage y la de ADE hay otra, al principio, que se llama "Archivos Calibre" con dos archivos en su interior. Elimino esta carpeta, expulso y reseteo el lector y desaparece aquel mensaje que indicaba que el sistema Kobo no reconocía la micro.

¿Os ha pasado a alguien? ¿Sabéis la solución a este problema? A l@s que domináis la lengua de Obama ¿habéis leído algo sobre esto en MobilRead?

Gracias por vuestra ayuda.